RTPCR(生物科学技术)

由网友(Pull(难挽))分享简介:RTPCR即反转录·聚拢酶链反映,是将RNA的反转录(reverse transcription )以及cDNA的聚拢酶链式扩删(PCR)相联合的技能。中文名反转录·聚拢酶链反映简写RTPCR英文名reverse transcription-polymerase chain reaction类属熟物科教技能基原内容RT-...

RTPCR即反转录·聚合酶链反应,是将RNA的反转录(reverse transcription )和cDNA的聚合酶链式扩增(PCR)相结合的技术。

中文名

反转录·聚合酶链反应

简写

RTPCR

英文名

reverse transcription-polymerase chain reaction

类属

生物科学技术

基本内容

8.PCR 和 RT PCR

RT-PCR简介  反转录·聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction, RT-PCR)是将RNA的反转录(reverse transcription )和cDNA的聚合酶链式扩增(PCR)相结合的技术。首先经反转录酶的作用从RNA合成 cDNA,再以cDNA为模板,扩增合成目的片段。RT-PCR技术灵敏而且用途广泛,可用于检测细胞中基因表达水平,细胞中RNA病毒的含量和直接克隆 特定基因的cDNA序列。作为模板的RNA可以是总RNA、mRNA或体外转录的RNA产物。无论使用何种RNA,关键是确保RNA中无RNA酶和基因组 DNA的污染。

技术原理

  只要是利用相关技术提取组织或细胞中的总RNA,以其中的mRNA作为模板,采用Oligo(dT)或随机引物利用反转录酶反转录成cDNA。再以cDNA为模板经行PCR扩增,而获得目的基因或检测基因表达。

技术过程

  RT-PCR可以用一步法或两步法的形式进行。在两步法RT-PCR中,每一步都在最佳条件下进行。cDNA的合成首先在反转录缓冲液中进行,然后取出1/10的反应产物进行PCR。在一步法RT-PCR中,在同时为反转录和PCR优化的条件下,反转录和PCR在一直观众顺次进行。

  1、反转录酶的选择

两种方法

[1]

1、Money 鼠白血病病毒反转录酶

  有较强的聚合酶活性,RNA酶H活性相对较弱。最适作用温度为37°。

  2、AMV反转录酶

  有强的聚合酶活性和RNA酶H活性。最适温度为42°。

  2、合成cDNA引物的选择

  用于反转录的引物可视实验的具体情况选择随机引物、Oligo dT 及基因特异性引物中的一种。对于短的不具有发卡结构的真核细胞mRNA,三种都可。

一步法

[2]

 RT-PCR引物的选择:

  1. 随机引物 适用于长的或具有发卡结构的RNA。适用于rRNA、mRNA、tRNA 等所有RNA的反转录反应。主要用于单一模板的RT-PCR反应。

两步法

[3]

  2. Oligo dT 适用于具有PolyA尾巴的RNA。(原核生物的RNA、真核生物的 Oligo dT rRNA

  和tRNA不具有PolyA尾巴。)由于Oligo dT要结合到PolyA 尾巴上,所以对RNA样品的质量要求较高,即使有少量降解也 会使全长cDNA合成量大大减少。

  3. 基因特异性引物 与模板序列互补的引物,适用于目的序列已知的情况。

影响因素

  RT-PCR反应受多个因素影响,如硫酸镁的浓度, 引物退火的温度,扩增的循环数等。

  1、建议选择0.5-3.0 mM (相差0.5 mM)的硫酸镁作初步实验。

  2、对于具有较高Tm的引物,增加退火和延伸时的温度对反应有利。较高的温度有利于减少非特异的引物结合,因而提高特异产物的得率。

  3、大多数目标RNA经40轮PCR反应就能观察到。但如果目标RNA太稀少,或者只有很少的起始材料,有必要增加扩增的次数到45-50次。

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